Madden 16 krijgt een nieuwe modus die speciaal is ontwikkeld voor Fantasy Football-spelers. In Draft Champions staat dan ook het belangrijkste gedeelte van het hele Fantasy-gebeuren centraal: het uitkiezen van je spelers. In de nieuwe modus kies je uit drie coaches en krijg je een gemiddeld team toebedeel.
Daarna zijn er vijftien Draft rondes. In elke ronde krijg je drie sterke spelers voorgeschoteld, waaruit je er een mag kiezen. Wie de spelers zijn en welke positie ze spelen is elke keer weer anders. Na de vijftien rondes ga je aan de slag tegen de computer of online tegen andere gamers. Ook worden er vrouwenteams toegevoegd.
