Een verwoestende pandemie maakt zijn weg door New York City, en een voor een vallen de basisdiensten weg. In slechts enkele dagen, zonder eten of drinken, stort de maatschappij in chaos. De divisie, een geklasseerde eenheid van zelf-ondersteunde tactische agenten, wordt geactiveerd. De agenten leiden ogenschijnlijk gewone levens onder ons, The Division agenten zijn echter opgeleid om zelfstandig te opereren zonder bevelhebber, voor als al het andere faalt.
Vechtend om de val van de samenleving te voorkomen, zullen de agenten een epische samenzwering ontdekken. Hierdoor worden de agenten gedwongen om niet alleen de gevolgen van een door de mens veroorzaakt virus te bestrijden, maar ook de toenemende dreiging van degene die het hebben veroorzaakt. Als alles instort, begint je missie.